Je traiterai des données bulk rna seq fastq et effectuerai une analyse d'expression différentielle

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Bioinformatique et analyse de données de séquençage

Je suis doctorant en informatique médicale avec une expérience en médecine clinique et en recherche en bioinformatique. Je traite des données bulk RNA-seq, des données FASTQ de cellule unique avec Cel...
À propos de ce service

Traitement de l'RNA-seq en bulk : 8 USD par échantillon.

Tarification par volume pour la commande : 1-5 échantillons 8 USD chacun ; 6-19 7,20 USD ; 20-49 6,40 USD ; 50-99 5,60 USD ; 100+ 4,80 USD. La remise la plus élevée applicable s'applique à tous les échantillons ; pas de cumul.

Forfaits : 5 échantillons 40 USD ; 25 échantillons 160 USD ; 50 échantillons 280 USD. Contactez-moi pour d'autres quantités et une offre personnalisée. Les frais/taxes de Fiverr sont séparés.

Workflow : FastQC/fastp, HISAT2, featureCounts, plus une comparaison DESeq2, PCA, volcano/heatmap et GO ou GSEA lorsque la conception de l’étude le permet. Un seul échantillon ne supporte que le traitement en amont ; l’analyse différentielle nécessite des réplicats biologiques.

Humain, souris ou rat ; référence appropriée requise. Jusqu’à 30 millions de paires de lectures par échantillon. Même référence et workflow convenu pour chaque commande. Livrables : QC, tableaux, scripts/paramètres, README en anglais des méthodes et une révision de scope.

Envoyez le nombre d’échantillons, le type d’analyse, la profondeur, les groupes et la référence avant de commander. Les contrastes supplémentaires, références spéciales et analyses plus approfondies nécessitent un scope séparé. Transfert de données autorisé uniquement. Traitement uniquement ; pas de service de téléchargement autonome. Usage pour la recherche ; pas d’interprétation clinique ni de garantie de signification.

Langage de programmation:

R

Technologie:

Autres

Type d'analyse:

Analyse quantitative

•

analyse statistique

Expertise:

Statistiques

•

Tests d'hypothèses

Outils:

RStudio