Je traiterai des données bulk rna seq fastq et effectuerai une analyse d'expression différentielle
Bioinformatique et analyse de données de séquençage
À propos de ce service
Traitement de l'RNA-seq en bulk : 8 USD par échantillon.
Tarification par volume pour la commande : 1-5 échantillons 8 USD chacun ; 6-19 7,20 USD ; 20-49 6,40 USD ; 50-99 5,60 USD ; 100+ 4,80 USD. La remise la plus élevée applicable s'applique à tous les échantillons ; pas de cumul.
Forfaits : 5 échantillons 40 USD ; 25 échantillons 160 USD ; 50 échantillons 280 USD. Contactez-moi pour d'autres quantités et une offre personnalisée. Les frais/taxes de Fiverr sont séparés.
Workflow : FastQC/fastp, HISAT2, featureCounts, plus une comparaison DESeq2, PCA, volcano/heatmap et GO ou GSEA lorsque la conception de l’étude le permet. Un seul échantillon ne supporte que le traitement en amont ; l’analyse différentielle nécessite des réplicats biologiques.
Humain, souris ou rat ; référence appropriée requise. Jusqu’à 30 millions de paires de lectures par échantillon. Même référence et workflow convenu pour chaque commande. Livrables : QC, tableaux, scripts/paramètres, README en anglais des méthodes et une révision de scope.
Envoyez le nombre d’échantillons, le type d’analyse, la profondeur, les groupes et la référence avant de commander. Les contrastes supplémentaires, références spéciales et analyses plus approfondies nécessitent un scope séparé. Transfert de données autorisé uniquement. Traitement uniquement ; pas de service de téléchargement autonome. Usage pour la recherche ; pas d’interprétation clinique ni de garantie de signification.
Langage de programmation:
R
Technologie:
Autres
Type d'analyse:
Analyse quantitative
•
analyse statistique
Expertise:
Statistiques
•
Tests d'hypothèses
Outils:
RStudio
FAQ
Traduction automatique
Que dois-je envoyer avant de commander ?
Envoyez l'organisme, le test, le nombre d'échantillons, le nombre de paires de lectures, la version de référence et les métadonnées des échantillons avec les groupes et contrastes. Tous les packages acceptent FASTQ. L'analyse différentielle nécessite une conception d'étude appropriée et des réplicats biologiques. Convenez d'une méthode de transfert de données autorisée et sécurisée avant de passer commande.
