Je réaliserai la métagénomique, la transcriptomique, l'épigénétique, l'analyse de données singlecell pour vous

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Je parle Anglais, Hindi

Bioinformaticien

Je suis un bioinformaticien avec une forte expérience dans l’analyse de données de séquençage NGS et Nanopore, la découverte de médicaments assistée par ordinateur, et le développement de pipelines ML...
À propos de ce service

La métagénomique, le RNA bulk et single-cell RNA Seq, ainsi que tout type d'analyse de données génomiques et bioinformatique sont inclus dans ce service.


Si vous avez des données génomiques provenant de n'importe quelle plateforme (courte lecture ou longue lecture) nécessitant une analyse, des insights, et des visualisations avec interprétation, vous êtes au bon endroit.


Je suis bioinformaticien de formation et scientifique en bioinformatique par profession.

Je travaille avec des chercheurs, des universitaires, des équipes de santé publique et de biotechnologie sur des projets de bioinformatique, métagénomique (séquençage du génome entier, 16S), transcriptomique, biologie du cancer, épidémiologie, maladies infectieuses et GWAS.


Je serai heureux de proposer les services suivants :

Analyse de base et approfondie : QC des données, cartographie et alignement, phylogénie, assemblage et annotation, classification taxonomique, analyse statistique (expressions différentielles, diversité alpha-bêta, analyse de syntenie, détection de variants)


Visualisations prêtes pour publication : graphiques volcano, PCoA, UMAP, arbres phylogénétiques, graphiques, heatmaps, circlograms


Ce que je demande de votre part :

J'accepte les fichiers FASTQ ou FASTQ.GZ, BAM, VCF, matrices de comptage, ainsi que les numéros d'accession GEO ou SRA provenant d'Illumina, Nanopore ou toute autre plateforme

Technologie:

Excel

Google Sheets

Jupyter Notebook

MATLAB

RStudio

Type d'analyse:

Analyse quantitative

Analyse qualitative

Expertise:

Conception expérimentale

Algorithmes

Prédiction

Langage de programmation:

Python

R

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