Je ferai de la bioinformatique, du ngs, du rnaseq et de l'analyse du transcriptome

Bonjour, je suis Shohel Islam, bioinformaticien et biotechnologue. Je réaliserai WGS, RNA-seq, 16s rRNA-seq, ncRNA-seq (miRNA, lncRNA), et analyse de données de microarray en Linux terminal et RStudio. Si vous avez des difficultés à comprendre des projets liés au NGS, je suis là pour vous aider. J’ai travaillé sur plusieurs articles de recherche et je sais quel type de données est nécessaire.

Quelques exemples de mes articles de recherche :

1. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0317008
2. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0319952
3. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0319176
4. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0309353
5. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0298543

Vous pouvez faire appel à mes services pour :

• Récupération de données depuis la base SRA / lectures brutes RNA-Seq personnalisées.
• Contrôle de la qualité des lectures brutes (Fastqc).
• Trimming des lectures de mauvaise qualité et des adaptateurs.
• Alignement des lectures brutes.
• Génération de la matrice de comptage des features.
• Normalisation des données (RPKM/FPKM/TPM).
• Analyse différentielle des gènes.
• Listes de gènes régulés à la hausse et à la baisse.
• Prédiction de l’ARN non codant
• Appel de variants et leur annotation
• Analyse de transcriptomique spatiale

Veuillez m’envoyer un message d’abord pour confirmer ma disponibilité dans votre délai et ma capacité à réaliser ce que vous demandez. Merci !