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Je réaliserai des simulations de dynamique moléculaire MD avec gromacs, lammps ou cp2k
Expert en simulation MD et DFT
En tant que chercheur en doctorat en chimie computationnelle et science des matériaux avec plus de 5 ans d’expérience dédiée, je propose des services de simulation moléculaire professionnels et de hau...
À propos de ce service
En tant que chercheur en doctorat en chimie computationnelle avec plus de 5 ans d’expérience pratique, je propose des simulations de dynamique moléculaire de niveau expert. Je réalise personnellement chaque étape de calcul et d’analyse des données directement. Il n’y a absolument pas d’intermédiaires, ce qui garantit une confidentialité stricte des données, une rigueur scientifique et une communication très efficace.
Mon expertise en GROMACS inclut :
- Biomolécules : protéines, nanobodies et interactions complexes avec des ligands.
- Polymères & matière molle : conformations de chaînes, états d’agrégation et évolution structurale.
- Systèmes complexes : membranes composites (par exemple cellulose, MXene, nanotubes de carbone).
Ce que je fournis :
- Génération précise de topologies (AMBER, OPLS-AA, CHARMM).
- Exécutions MD de production (NPT/NVT).
- Analyse approfondie (RMSD, RMSF, RDF, liaisons H, MSD).
- Rendu 3D prêt pour publication avec VMD et PyMOL.
Veuillez m’envoyer un message avant de passer commande pour discuter de votre système spécifique !
FAQ
Traduction automatique
Utilisez-vous des intermédiaires ou externalisez-vous les calculs ?
Absolument pas. Je suis un chercheur en doctorat indépendant. Je construis personnellement les modèles, soumets les tâches à des clusters de calcul haute performance (HPC) et réalise toutes les analyses de données moi-même.
Quels logiciels utilisez-vous pour les simulations MD et la visualisation ?
J’utilise principalement GROMACS, LAMMPS et CP2K pour les simulations. Pour un rendu et une analyse de haute qualité, prêt pour publication, j’utilise VMD, PyMOL et Multiwfn.
