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Je vais créer des outils bioinformatiques personnalisés en Python
Développeur en bioinformatique et ETL
Je me spécialise dans les pipelines de données en bioinformatique et l’architecture ETL, avec une solide expérience en développement Python. Récemment, j’ai conçu et déployé six applications de bio-do...
À propos de ce service
Vous avez besoin d'analyser des séquences de données biologiques, des mutations ou des structures de protéines mais vous ne souhaitez pas passer des semaines à écrire des scripts from scratch ? Je conçois des outils bioinformatiques en Python qui réalisent l'analyse et vous fournissent des résultats clairs et exploitables.
Ce que j'ai réalisé : un simulateur d'édition génétique CRISPR (scan de 857 sites PAM sur le gène HBB), un traqueur de mutations de variants COVID (Omicron BA.3.2, 91 mutations identifiées), un analyseur de structures protéiques (testé sur la sickle cell E6V et BRCA1 C61G), et un explorateur d'interactions médicament-cible (Imatinib mappé à 45 cibles).
Portfolio : github.com/CodeXSourabhsingh
Ma stack : Python, Biopython, Pandas, NumPy, MySQL, Streamlit, Py3Dmol, NCBI Entrez, RCSB PDB, ChEMBL.
Ce que vous obtenez :
- Code fonctionnel, pas de pseudocode
- Données réelles issues de bases publiques, pas des exemples fictifs
- Structure claire, documentée
- 30 jours de corrections de bugs
Envoyez-moi un bref descriptif de vos données biologiques, de la question à laquelle vous souhaitez répondre, et du résultat attendu. Je vous répondrai dans les 24 heures avec un devis et un délai.
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Technologie:
Python
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FAQ
Traduction automatique
Avec quel type de données biologiques travaillez-vous ?
Séquences ADN/ARN (FASTA), structures de protéines (PDB), tableaux d'expression génique (CSV), données de variants (VCF), et toute base de données bio publique via API.
Fournissez-vous les données ?
Non. Vous fournissez les données ou la question biologique. Je récupère depuis des sources publiques si nécessaire — NCBI, PDB, ChEMBL.
Pouvez-vous créer un outil pour mon organisme spécifique ?
Oui, tant que des données de référence existent pour celui-ci. Les outils universels sont ma spécialité — même moteur, n'importe quel organisme.
Comment puis-je être sûr que l'outil fonctionne ?
Je vous envoie un enregistrement vidéo de son fonctionnement avec de vraies données. Vous pouvez le tester avant la livraison finale.
Qu'est-ce qui différencie votre travail de celui d'autres développeurs ?
J'ai déployé 5 applications bio-data en 17 jours. Mes outils utilisent de vraies données de NCBI, ChEMBL et PDB — et l'une d'elles a été validée publiquement par le CEO d'une entreprise eClinical native IA.
