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Je vais effectuer une analyse bioinformatique et un alignement de séquences
Analyste statistique, analyse de données de thèse et rédaction de recherche
Analyste statistique et consultant en recherche académique avec une licence en élevage et génétique animale (FUNAAB, 2025). Je me spécialise dans le traitement des données, l'interprétation statistiqu...
À propos de ce service
Bienvenue dans mon service professionnel d’analyse bioinformatique et de données moléculaires. Je fournis un traitement précis des séquences, la construction d’arbres évolutifs et des métriques de diversité génétique pour les chercheurs et biologistes.
En utilisant des outils informatiques standards de l’industrie, je vais extraire des insights biologiques significatifs de vos jeux de données de nucléotides ou de protéines.
Ce que je propose :
Alignement de séquences (MSA) : Édition détaillée, nettoyage et alignement des séquences avec BioEdit, ClustalW ou MUSCLE.
Analyse phylogénétique : Construction avancée d’arbres évolutifs avec le logiciel MEGA (Maximum Likelihood, Neighbor-Joining) avec un support robuste de bootstrap.
Diversité génétique : Calcul des polymorphismes ADN, de la diversité des haplotypes et des métriques de variance génétique avec DnaSP.
Interrogation de bases de données : Recherches NCBI BLAST et collecte de séquences.
Exportations prêtes : Formatage et rendu de haute qualité des arbres et fichiers d’alignement (.fasta, .meg, .nwk).
Outils que j’utilise :
MEGA, BioEdit et DnaSP
Bases de données et outils web NCBI
R / RStudio (pour des graphiques analytiques personnalisés)
Veuillez m’envoyer un message avant de passer commande afin que nous puissions discuter de vos formats de données spécifiques et de vos objectifs de projet !
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FAQ
Traduction automatique
Quels formats de fichiers acceptez-vous pour l’alignement de séquences ?
J’accepte les formats de fichiers standards en biologie moléculaire, notamment FASTA, GenBank (.gb), MEGA (.meg) et phylip (.phy), ainsi que les textes bruts de séquences non formatés.
Quelles méthodes d’arbre phylogénétique pouvez-vous réaliser avec MEGA ?
Je peux construire des arbres en utilisant les méthodes Maximum Likelihood (ML), Neighbor-Joining (NJ), Minimum-Evolution (ME) et UPGMA, avec un support de bootstrap personnalisé.
Pouvez-vous calculer la diversité des haplotypes ou les sites polymorphes ?
Avec DnaSP, je peux analyser des données de génétique des populations pour déterminer le nombre de sites polymorphes, la diversité des haplotypes (Hd), la diversité en nucléotides (\pi) et la variance des séquences.
