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Je vais effectuer une analyse de docking moléculaire avec autodock vina pour votre recherche
Je suis diplômé en biochimie (MPhil, 4.0 de moyenne) avec une expérience pratique en recherche dans la découverte de médicaments par informatique. Mon travail inclut la validation de structures de pro...
À propos de ce service
Docking moléculaire précis pour votre recherche, mémoire ou publication
Je possède un MPhil en biochimie (note de 4.0) avec une expérience en recherche dans la découverte de médicaments par calcul, y compris le criblage virtuel basé sur la structure pour des cibles médicamenteuses potentielles, avec quelques publications et plusieurs articles soumis. Je fournis une analyse de docking fiable et bien documentée que vous pouvez inclure en toute confiance dans votre mémoire, vos cours ou votre publication.
Les services incluent :
- Récupération et validation de la structure des protéines (SAVES, analyse de Ramachandran)
- Identification du site actif (PrankWeb, I-TASSER ou basé sur la littérature)
- Préparation du ligand et du récepteur (AutoDockTools)
- Docking moléculaire avec AutoDock Vina (ligand unique ou criblage virtuel en batch)
- Analyse de l’affinité de liaison et visualisation des interactions en 2D/3D
- Rapport clair et structuré avec graphiques et tableaux
Convient aux étudiants en master, chercheurs et universitaires ayant besoin d’un support fiable pour le docking dans le cadre de leur mémoire, cours ou publications.
Note : Ce service couvre uniquement le docking et le criblage virtuel ; la simulation de dynamique moléculaire (MD) n’est pas proposée pour le moment.
Type de service:
Recherches
Langue:
Anglais
Préférence du type de livraison
Veuillez informer le freelance de toute préférence ou préoccupation concernant l'utilisation d'outils d'IA dans la réalisation et/ou la livraison de votre commande.
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FAQ
Traduction automatique
De quelles informations avez-vous besoin de ma part pour commencer ?
Veuillez fournir la protéine cible (ID PDB ou fichier de structure) et le(s) ligand(s) que vous souhaitez faire docké(s) (nom, fichier de structure ou SMILES/ID du composé). Si vous ne connaissez pas précisément le site de liaison, faites-le moi savoir, je peux vous aider à l’identifier à l’aide de la littérature ou d’outils de prédiction comme PrankWeb.
Vais-je recevoir les fichiers bruts, pas seulement un rapport ?
Oui. Vous recevrez les fichiers de sortie du docking (PDBQT, fichiers log), les scores d’affinité de liaison, et un rapport clair résumant les résultats.
Ces résultats conviennent-ils pour un mémoire ou une publication ?
Oui, je fournis des résultats clairs et bien documentés que vous pouvez inclure en toute confiance dans votre mémoire, vos cours ou votre article. (Note : les résultats doivent encore être interprétés/discutés dans le contexte de votre recherche spécifique. Je fournis l’analyse computationnelle, pas la rédaction académique environnante.)
Mes données sont-elles gardées confidentielles ?
Oui, votre protéine cible, vos composés et vos résultats restent entièrement confidentiels.
