Je vais effectuer la détection de variants génomiques et l'annotation de gènes avec gatk

Certaines informations ont été traduites automatiquement.
Ali Naqvi

Pakistan

Je parle Ourdou, Anglais

Spécialiste en bioinformatique et IA biomédicale

Je suis un spécialiste en bioinformatique et IA biomédicale, fournissant des résultats de recherche précis et reproductibles. - Analyse NGS, RNA-seq et WGS - RNA-seq à cellule unique — clustering, UM...
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À propos de ce service

Avez-vous des données de séquence génomique et besoin d'aide pour l'identification de variants ou l'annotation de gènes ? Je réaliserai une analyse génomique claire, bien documentée et livrerai des résultats que vous pourrez utiliser directement dans votre recherche ou votre mémoire.


Ce que je propose :

  • Contrôle de qualité et trimming de la séquence ADN (FastQC, Trimmomatic)
  • Alignement sur le génome de référence (BWA, Bowtie2)
  • Appel de variants SNP et indel (GATK, bcftools)
  • Annotation et filtrage de variants (SnpEff, ANNOVAR)
  • Recherche de gènes et annotation fonctionnelle (Prokka, BLAST)
  • Graphiques Manhattan, tableaux récapitulatifs de variants et rapport écrit


Tous les scripts (Python/Bash/R) sont inclus pour que votre analyse soit entièrement reproductible. Je travaille avec des génomes humains, végétaux et microbiens.


Contactez-moi avec vos fichiers FASTQ ou VCF et les détails de l'organisme avant de passer commande.

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do genomics variant calling and gene annotation using gatk
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do genomics variant calling and gene annotation using gatk