Je vais effectuer des tâches complexes en bioinformatique

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Bioinformaticien

Je suis bioinformaticien spécialisé dans les pipelines génomiques à haut débit et les applications évolutives en sciences de la vie. Je transforme des données biologiques complexes en insights exploit...
À propos de ce service

Des services professionnels en bioinformatique pour l’analyse de bulk RNA-sequencing et de données de transcriptomique sont fournis. En utilisant des techniques avancées de biologie computationnelle, les données de séquençage brut sont transformées en insights biologiques prêts à être publiés.


Une méta-analyse de transcriptomique est réalisée en obtenant des données à partir des bases de données Gene Expression Omnibus (GEO) et TCGA. Après une analyse différentielle de l’expression génétique, un réseau d’interactions protéine-protéine (PPI) des DEGs significatifs est construit.


Services principaux :

  • Prétraitement des données et analyse statistique.
  • Analyse différentielle de l’expression des gènes, miRNA et méthylation.
  • Annotation fonctionnelle et analyse d’enrichissement.
  • Pathways d’interaction protéine-protéine et génétique.
  • Analyse de réseau utilisant Cytoscape et R-programming.
  • Visualisation des données.


Infrastructure & outils :

  • R, Python.
  • Cluster haute performance, RStudio, Anaconda, Jupyter, Docker, Spyder.


Il est recommandé de communiquer au préalable avant de passer commande pour discuter des exigences spécifiques du projet et des paramètres du dataset.

Langage de programmation:

Python

R

Technologie:

Jupyter Notebook

Autres

Type d'analyse:

Analyse quantitative

Analyse qualitative

Expertise:

Conception expérimentale

Algorithmes

probabilité

maths

Outils:

RStudio

Google Colab

Autres

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