Je réaliserai une simulation de dynamique moléculaire pour vous

Je peux effectuer une simulation de dynamique moléculaire pour vos besoins de recherche. Je couvrirais tous les réglages de base, l'exécution et l'analyse.

Je peux réaliser des simulations gromacs/htmd avec une structure de protéine fournie, où vous pouvez également spécifier le forcefield/autres paramètres. Après les phases d'équilibrage et de production, une analyse du RMSD, RMSF et Rg de la simulation sera effectuée. Veuillez préciser si vous avez besoin d'une analyse de ligand, où une analyse mmgbsa/pbsa et/ou de formation de liaison est requise.

Des figures utilisant R ggplot seront également générées selon vos besoins. La simulation finale et l'analyse vous seront toutes retournées.