Je réaliserai une simulation de dynamique moléculaire, conception de voie, dft, qsar

Je vous aiderai dans la découverte de médicaments in silico en utilisant des outils standard de l'industrie tels que GROMACS, ORCA, AutoDock, Schrödinger et la chimioinformatique basée sur Python .

Ce service comprend des services tels que :

Amarrage moléculaire (protéine-ligand) à l'aide de Glide/MOE/AutoDock

Simulation MD dans GROMACS et 100 ns d'un complexe en seulement ~6 heures (GROMACS jusqu'à 5000 ns)

• RMSD
• RMSF
• SASA
• RG
• Liaison H
• DCCM
• PSA
• PCA
• DSSP
• FEL

Modélisation QSAR

• 2D/3D
• Régression IC50/pIC50
• Optimisation des descripteurs

Calculs DFT :

• Écart HOMO-LUMO, tracés orbitaux, cartes ESP
• Optimisation de la géométrie, fréquences IR
• UV/Vis (TD-DFT), fluorescence

Modélisation de pharmacophores et criblage virtuel

Calculs d'énergie de liaison

• MM-GBSA
• MM-PBSA

Visualisation 3D/2D des interactions de liaison protéine-ligand

Facultatif:

• Méthode
• Section Résultats et Discussion pour publication/thèse

Vous recevrez :

• fichiers .pdb/.xyz/.csv
• analyse écrite
• Feuilles de score + graphiques
• Images d'interactions 300/500/600 dpi

Que vous soyez un étudiant en doctorat/master , un chercheur universitaire ou un scientifique de l'industrie , je fournis des résultats rapides et précis avec des visuels de qualité publication.

Avant de passer votre commande, envoyez-moi un message pour vous assurer que vos cibles et ligands sont compatibles avec les outils