Je réaliserai des études de docking moléculaire et de criblage virtuel
Spécialiste en docking moléculaire, DFT et simulation MD
À propos de ce service
Je réaliserai un docking moléculaire ou un workflow de criblage virtuel ciblé pour des études sur les protéines et ligands, et je fournirai des résultats clairs et organisés.
Le travail peut inclure la préparation du récepteur et du ligand, la définition du site de liaison, la configuration du docking, la redocking ou la validation de contrôle si nécessaire, le classement des poses, l’analyse des interactions, des visualisations 2D/3D de la liaison, et un rapport concis sur les méthodes et résultats. Pour les projets de criblage, le nombre final de composés et le workflow de filtrage seront convenus avant la commande.
Veuillez m’envoyer d’abord un message avec la structure de la protéine ou l’ID PDB, les fichiers ligand ou la taille de la bibliothèque, les résidus du site de liaison connus ou le ligand de référence, le logiciel préféré si vous en avez, et l’objectif de l’étude. Les scores de docking sont des estimations computationnelles comparatives et ne constituent pas une preuve expérimentale d’activité biologique.
FAQ
Traduction automatique
Comment le site de liaison est-il choisi ?
J’utilise un ligand co-cristallisé, des résidus issus de la littérature, ou un site que vous fournissez. Je confirme le site cible avec vous avant la réalisation du docking.
