Je réaliserai une analyse de données en bioinformatique et pipelines RNA-Seq

Bienvenue dans mon service d’analyse en bioinformatique et RNA-Seq !

Vous cherchez un biologiste computationnel fiable pour transformer vos données génomiques brutes en insights biologiques exploitables ? Avec un Master en sciences de la vie (Botanique) et des certifications spécialisées en Data Science et IA en Pharma, je fais le lien entre la biologie complexe et l’analyse avancée de données.

Ce que je propose (mon pipeline d’analyse) :

• Contrôle de qualité (QC) : Évaluation et trimming des lectures brutes avec FastQC et fastp.
• Alignement de séquences : Cartographie précise vers les génomes de référence avec HISAT2 / STAR.
• Quantification : Comptage des lectures et génération de matrices d’expression génique avec FeatureCounts.
• Expression différentielle des gènes (DGE) : Analyse statistique avec DESeq2 (R).
• Visualisation des données : Graphiques de haute qualité prêts pour publication (volcano plots, heatmaps, PCA).

Ma stack technologique :

• Linux CLI & scripting Bash
• Python (Pandas, NumPy)
• R & RStudio
• Outils de bioinformatique (SRA Toolkit, Samtools)

Pourquoi me choisir ? Contrairement à un simple programmeur, je possède une compréhension approfondie des jeux de données biologiques. Je fournis des pipelines propres, bien documentés et automatisés, avec un souci de précision.

Note : Merci de m’envoyer un message avant de passer commande.