Je réaliserai de la modélisation par homologie, du docking moléculaire et des simulations MD

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Bioinformatique structurale

Doctorant spécialisé en bioinformatique structurale et découverte de médicaments assistée par IA. Je peux fournir des solutions de recherche prêtes à être publiées en utilisant des protocoles standard...
À propos de ce service

Accélérez vos recherches avec des services professionnels de découverte de médicaments par calcul. En tant que doctorant en bioinformatique structurale, je propose des simulations rigoureuses, prêtes à être publiées, et des analyses adaptées à vos cibles biologiques spécifiques.

Ce que j'offre :

  1. Consultation : Discussion sur les différentes approches possibles pour résoudre les tâches.
  2. Méthodologie détaillée : Les subtilités des entrées, méthodes et outils.
  3. Modélisation par homologie : Prédiction de structures 3D de haute qualité (AlphaFold2/Modeller) avec validation (Ramachandran, ERRAT, Verify3D).
  4. Docking moléculaire : Docking complet de protéines-ligands, protéines-protéines et protéines-ADN utilisant AutoDock Vina, MoleDock ou HADDOCK.
  5. Simulations MD (GROMACS) : Simulations avancées de complexes. Je fournis RMSD, RMSF, rayon de giration, stabilité des liaisons H et graphiques SASA.
  6. Énergie de liaison : Calcul précis de l'affinité avec les méthodes MMPBSA/GBSA.
  7. QSAR & ML : Modèles d'apprentissage automatique pour prédire l'activité et la toxicité des composés.

Pourquoi travailler avec moi ? Je ne me contente pas d'exécuter des logiciels ; je propose des solutions pour des problématiques complexes en bioinformatique.

Vous recevrez :

  • Des images de visualisation 3D en haute résolution.
  • Des graphiques et tableaux de données de qualité publication.
  • Des rapports méthodologiques détaillés pour vos manuscrits.

Domaine:

Machine learning

Autres

Expertise:

Analyse prédictive

Langage de programmation:

Python

Outils:

Jupyter Notebook

Excel

Autres

Technologie:

Python

Colab

Excel

Autres

Modélisation et méthodes:

Machine learning