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Je réaliserai une analyse bioinformatique de séquençage RNA et fournirai un rapport clair
Analyste en bioinformatique, Analyse de données en génomique
Je suis analyste en bioinformatique et chercheur en doctorat en génétique, avec une expérience en génomique, transcriptomique et analyse de données biologiques. Je travaille avec Python, R, Bash, Linu...
À propos de ce service
Je propose une analyse bioinformatique claire et reproductible pour les projets de RNA-seq et de transcriptomique.
Le package Basic concerne les données de RNA-seq traitées, telles qu'une matrice de comptage, un tableau d'expression, une annotation de transcript ou d'autres fichiers prêts pour l'analyse. Il couvre jusqu'à 12 échantillons et une comparaison définie.
Selon vos données et votre question de recherche, l'analyse peut inclure :
-Vérification, filtrage et normalisation des données
-Analyse en composantes principales (ACP) et regroupement des échantillons
-Analyse différentielle de l'expression génique
-Tableaux de DEG et résumés d'expression
-Heatmaps, diagrammes en volcan et autres visualisations
-Analyse au niveau du transcript ou de l'isoforme pour les jeux de données appropriés
-Scripts reproductibles en R ou Python
-Un résumé concis des méthodes et des résultats clés
Les livrables peuvent inclure des tableaux traités, des figures, des scripts et un résumé des résultats.
Veuillez me contacter avant de commander. Envoyez votre organisme, le nombre d'échantillons, les groupes expérimentaux, les types de fichiers disponibles et la principale question de recherche.
Le traitement brut FASTQ, plus de 12 échantillons, les comparaisons multiples, les designs complexes, la découverte d'isoformes longue lecture et l'enrichissement fonctionnel ne sont pas inclus dans le package Basic. Ces services peuvent faire l'objet d'un projet personnalisé.
