Je vais effectuer des docking et des simulations de dynamique moléculaire

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Usman Shahid
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À propos de ce service

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Bonjour Fiverr, je suis Usman. Biologiste computationnel spécialisé dans la découverte de médicaments, l’inhibition des protéines et bien d’autres domaines. J’ai aidé des étudiants en doctorat et en MPhil à terminer leurs recherches.

  1. Docking Starter : Docking de 1 à 2 ligands avec la protéine cible + visualisation de l’affinité de liaison et de la pose. Analyse ADMET.
  2. Binding Insight : 5 à 10 ligands, analyse des interactions, cartographie du site de liaison, et scores de docking comparatifs. Analyse ADMET.
  3. Dynamic Discovery Suite : Docking complet + simulations MD (de 10 à 100 ns) avec RMSD, RMSF, Rg, et graphiques de stabilité de liaison. (Discuter si vous avez besoin de plus de temps pour les simulations.)
  4. Plus de services sont également disponibles pour rendre votre recherche plus impactante, comme MMPBSA, MMGBSA, analyse des liaisons H, etc.
  5. Si vous souhaitez discuter de projets de recherche, ils sont aussi disponibles.

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Usman Shahid

molecular docking, Molecular dynamic simulations

  • DePakistan
  • Membre depuisdéc. 2022
  • Temps de réponse moy.1 heure
  • Langues

    Anglais
I am a computational biology researcher specializing in structure-based drug discovery and molecular docking. I use AutoDock Vina and PyMOL to perform end-to-end virtual screening pipelines — from target protein preparation to ligand docking, interaction analysis, and drug-likeness evaluation using Lipinski and Veber filters. What you get: Target protein preparation from PDB Molecular docking using AutoDock Vina Virtual screening of compound libraries ADMET & drug-likeness evaluation 10-100ns simulations in AMBER Clean report with results and binding scores.

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