Je vais analyser les données scrna seq, transcriptomique spatiale et ngs

Obtenez une analyse de données NGS de qualité publication par un bioinformaticien expérimenté

Je me spécialise dans l’analyse des données de Next-Generation Sequencing (NGS), avec une expérience pratique dans la livraison de résultats pour des publications évaluées par des pairs. Je transforme les données brutes de séquençage en insights biologiques clairs, prêts à être publiés, soutenus par une solide connaissance du domaine en biologie expérimentale.

Services que je propose :

• Analyse scRNA-Seq : Contrôle qualité du pipeline complet, réduction de dimension (PCA/UMAP), clustering, annotation des types cellulaires, inférence de trajectoire (Seurat/Bioconductor)
• Transcriptomique spatiale : Intégration avec les données scRNA-seq, cartographie de l’expression génique à la morphologie tissulaire, identification génique spatiale
• RNA-Seq en bulk : FastQC, alignement, analyse différentielle d’expression (DESeq2), enrichment fonctionnel (GO/KEGG)
• Visualisation des données : Figures haute résolution, prêtes à être publiées (heatmaps, volcano plots, graphiques personnalisés avec ggplot2/ComplexHeatmap)

Outils & Technologies :

Langages : R (Tidyverse, Bioconductor), Bash/Linux

Types de données : FASTQ, BAM, VCF, matrices de comptage

Pourquoi travailler avec moi :

Méthodes basées sur la littérature actuelle et la rigueur académique

Code propre, reproductible avec des rapports d’analyse détaillés

Communication claire et délai rapide