Je réaliserai une analyse de données rnaseq et bioinformatique

Je propose un support en bioinformatique pour les projets de RNA-seq et transcriptomique, comprenant le contrôle de qualité, le trimming des reads, la quantification des transcripts, la génération de comptes de gènes, l’assemblage de transcriptome de novo et l’analyse de l’expression différentielle. Je crée également des graphiques PCA, des heatmaps, des volcano plots, des MA plots, des tableaux de comptes normalisés et des figures pour des gènes spécifiques d’intérêt. Je travaille dans des environnements R, Python et Linux et j’ai de l’expérience avec des outils tels que DESeq2, Salmon, tximport, featureCounts et fastp. Chaque projet est adapté à l’organisme, au design expérimental, aux fichiers de référence disponibles et aux questions spécifiques que vous souhaitez explorer.