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Je réaliserai des analyses d'amarrage moléculaire et d'interaction protéine-ligand
Étudiant en PhD en pharmacoinformatique
Je suis un chercheur spécialisé en recherche sur les plantes médicinales, taxonomie et pharmacoinformatique. J’ai une vaste expérience en docking moléculaire et en simulations de dynamique moléculaire...
À propos de ce service
Vous recherchez une analyse fiable et scientifiquement pertinente de docking moléculaire pour vos recherches ?
Je propose l’analyse de docking moléculaire et d’interactions protéine-ligand pour la recherche en biologie computationnelle, découverte de médicaments, phytochimie, produits naturels et domaines connexes.
Mes services incluent :
Docking moléculaire
Préparation des protéines et ligands
Docking moléculaire avec AutoDock/AutoDock Vina
Analyse de l’affinité de liaison
Évaluation des poses de docking
Analyse d’interaction
Liens hydrogène
Interactions hydrophobes
Interactions ππ et πalkyl
Interactions de Van der Waals
Identification des résidus d’interaction importants
Résultats et visualisation
Tableaux de scores de docking/affinité de liaison
Diagrammes d’interaction 2D protéine-ligand
Visualisations moléculaires 3D
Analyse comparative de plusieurs ligands
Figures prêtes pour publication
Je peux également fournir Lipinski, ADMET, BOILED-Egg, prédiction de toxicité, dynamique moléculaire (MD), RMSD/RMSF et analyse MM/PBSA en services additionnels.
J’ai une expérience en recherche dans la découverte de médicaments par calcul, le docking moléculaire, les simulations de dynamique moléculaire et l’analyse de l’énergie libre de liaison, et je privilégie des résultats clairs et interprétables scientifiquement.
Veuillez me contacter avant de passer commande
Technologie:
MATLAB
Type d'analyse:
Analyse qualitative
Expertise:
Conception expérimentale
Langage de programmation:
Python
FAQ
Traduction automatique
De quoi avez-vous besoin de ma part pour commencer l’analyse de docking ?
J’ai besoin de la structure de la protéine (ID PDB/fichier), des structures de ligand (SMILES, SDF, MOL ou PDB), et des informations sur le site de liaison si disponibles. Si vous n’êtes pas sûr du site de liaison, veuillez me contacter avant de commander.
Quel logiciel de docking utilisez-vous ?
J’utilise principalement AutoDock/AutoDock Vina pour le docking moléculaire et Discovery Studio, PyMOL et UCSF Chimera pour l’analyse et la visualisation des interactions moléculaires.
Recevrai-je les résultats et figures du docking ?
Oui. Selon le package choisi, vous pouvez recevoir les résultats d’affinité de liaison, l’analyse d’interaction, des diagrammes d’interaction 2D, des visualisations 3D et des tableaux comparatifs.
Pouvez-vous analyser des produits naturels ou des phytocomposés ?
Oui. Je peux analyser des phytocomposés, des produits naturels et d’autres petites molécules pour le docking protéine-ligand et l’analyse d’interaction.
