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J'analyserai les données rnaseq depuis les lectures brutes jusqu'à l'enrichissement fonctionnel
Bioinformaticien et chercheur en doctorat
Bonjour ! Je possède un MSc en Bioinformatique et je suis actuellement doctorant et chercheur dédié à la génomique et à la biologie moléculaire. J’ai une vaste expérience dans la gestion de données bi...
À propos de ce service
Bienvenue dans mon service de Bioinformatique & RNA-Seq !
Besoin d'une analyse rigoureuse, prête à être publiée, pour vos données RNA-Seq Illumina ? En tant que titulaire d’un MSc en Bioinformatique et doctorant en cours, je propose un traitement complet adapté à votre recherche. Je transforme des fichiers FASTQ bruts ou des matrices de comptage en résultats clairs et reproductibles.
Ce que je propose :
- Contrôle de qualité : FastQC et trimming des lectures.
- Alignement : Cartographie précise sur le génome de référence.
- Expression différentielle (DEGs) : Analyse statistique avec DESeq2.
- Enrichissement fonctionnel : Voies GO et KEGG via clusterProfiler.
- Graphiques prêts à publier : Heatmaps haute résolution, Volcano plots, PCA et réseaux.
Outils : R, Python et packages Bioconductor.
⭐ Pourquoi me choisir ?
- Rigueur académique : Chercheur actif développant des pipelines fiables.
- Reproductibilité : Scripts propres prêts pour votre section méthodes.
- Focus biologique : Dédié à votre question de recherche spécifique.
️ IMPORTANT : Merci de m’envoyer un message AVANT de passer commande ! Nous devons discuter de votre conception expérimentale et de la taille de votre échantillon pour garantir la meilleure offre personnalisée. Faisons publier votre article !
FAQ
Traduction automatique
Quels fichiers dois-je fournir pour commencer la commande ?
Cela dépend du pack choisi. Pour le pack de base, j’ai besoin de vos lectures de séquençage brutes (fichiers FASTQ). Pour les packs Standard et Premium, si vous avez déjà effectué l’alignement, vous pouvez fournir la matrice de comptage brute (.csv, .tsv ou .txt).
Combien d’échantillons sont inclus dans le prix de base ?
Les prix de base pour tous les packs couvrent une analyse jusqu’à 6 échantillons (par exemple, 3 témoins contre 3 traitements). Si votre conception expérimentale inclut plus d’échantillons, contactez-moi pour une offre personnalisée, car le temps de traitement augmentera.
Pouvez-vous analyser des données provenant d’organismes non modèles ?
Oui ! Tant qu’il existe un génome de référence annoté et un fichier GTF/GFF disponible dans des bases de données publiques (comme NCBI ou Ensembl), je peux réaliser l’analyse. Contactez-moi avant de commander pour vérifier la disponibilité du génome de référence pour votre organisme.
Recevrai-je les scripts utilisés pour mon analyse ?
Oui ! Si vous choisissez le pack Premium, je fournirai les scripts R ou Python propres et commentés utilisés pour générer vos résultats. Cela garantit une transparence totale et la reproductibilité, facilitant la rédaction de votre section méthodologie.
Et si je souhaite un graphique très spécifique ou hautement personnalisé pour mon article ?
Les packs Standard et Premium incluent déjà des graphiques de haute qualité (tels que PCA, Volcano plots et Heatmaps standards). Cependant, si vous avez besoin d’une figure très spécifique ou personnalisée (comme des réseaux d’interaction complexes ou des thèmes personnalisés), vous pouvez ajouter l’option "Graphique personnalisé supplémentaire".
Comment vous envoyer mes gros fichiers de données (FASTQ) ?
Fiverr a une limite de taille de fichier pour les téléchargements directs. Pour les gros fichiers de séquençage, vous pouvez partager un lien sécurisé via Google Drive, Dropbox, OneDrive ou directement depuis des serveurs ou dépôts de séquençage (comme SRA/ENA), et je les téléchargerai en toute sécurité.
