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Je réaliserai l'analyse différentielle d'expression et l'enrichissement de la séquence d'ARN
Développeur d'automatisation de l'IA
J'aide les entreprises à gagner du temps grâce à l'automatisation alimentée par l'AI.
Avec une expertise en Python et en Large Language Models (LLMs), je crée des outils pratiques qui transforment le...
À propos de ce service
Vous avez besoin d'analyser vos données RNA-seq mais vous manquez de temps ou d'expertise en bioinformatique ? Je vais exécuter le pipeline complet DESeq2 et livrer des résultats prêts à publication sans nécessiter de codage de votre côté.
Ce que je propose :
Analyse différentielle d'expression avec DESeq2 (la référence)
Figures prêtes à publication : diagrammes volcano, PCA, heatmaps
Analyse d'enrichissement GO & KEGG pour comprendre la signification biologique de vos gènes
Résultats clairs et organisés avec interprétation
Code R/Bioconductor reproductible inclus sur demande
Vous m'envoyez simplement votre matrice de comptage brut + métadonnées d'échantillons. Je m'occupe du reste.
Mon expérience : Je combine des connaissances en biologie avec des compétences informatiques rigoureuses. Je comprends la conception expérimentale, les voies biologiques, et ce que recherchent les reviewers dans un article, pas seulement comment exécuter du code.
Que vous soyez un étudiant en master préparant votre thèse, un postdoctorant pressé de soumettre un article, ou une entreprise biotech validant une cible, je peux vous aider à passer des données brutes à une compréhension biologique rapidement.
Consultez mon portfolio pour un exemple d'analyse réelle (GSE150910, 288 échantillons de maladies pulmonaires).
Des questions ? Contactez-moi avant de commander, je réponds en quelques heures.
Langage de programmation:
Python
•
R
Technologie:
Excel
•
Jupyter Notebook
•
Autres
Type d'analyse:
Analyse quantitative
•
analyse statistique
Outils:
RStudio
•
Google Colab
•
Microsoft Excel
•
Autres
FAQ
Traduction automatique
Que dois-je fournir pour que vous puissiez commencer ?
Une matrice de comptage brut (gènes en lignes, échantillons en colonnes) et un fichier de métadonnées indiquant à quel groupe appartient chaque échantillon. Si vous ne savez pas comment obtenir ces données à partir de votre séquençage, contactez-moi — je vous guiderai.
Je ne sais pas si mes données conviennent pour DESeq2. Pouvez-vous vérifier ?
Absolument ! Envoyez-moi d'abord vos données et je ferai une vérification rapide de la qualité avant votre commande. Si DESeq2 n'est pas adapté, je vous recommanderai une meilleure approche.
Travaillez-vous avec des données non humaines ?
Oui ! Je peux analyser des données RNA-seq de souris, rat, zebrafish, drosophile, Arabidopsis, et la plupart des organismes modèles. L'enrichissement GO/KEGG est limité aux organismes disposant de bases de données d'annotation.
Pouvez-vous rédiger la section méthodes de mon article ?
Oui, cela fait partie de mon package Premium. Je fournirai un paragraphe détaillé sur les méthodes que vous pourrez copier-coller directement dans votre manuscrit.
Que faire si j'ai besoin de révisions après la livraison ?
Chaque package inclut des révisions (1 pour Basic, 2 pour Standard, 3 pour Premium). Des révisions supplémentaires peuvent être achetées en option.
