Je réaliserai une analyse de l'expression différentielle de l'arn microbial avec deseq2 et snakemake

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Chercheur en biotechnologie : génomique microbienne et bioinformatique

Chercheur en biotechnologie & microbiologie avec plus de 4 ans d'expérience en génomique computationnelle. Mes travaux sont publiés dans des revues à comité de lecture (voir ma section 'Certificatio...
À propos de ce service

Bienvenue ! En tant que chercheur en doctorat en biorobotique & microbiologie, je propose une analyse experte pour les données de séquençage RNA microbien.


Je ne me contente pas d'exécuter du code ; je suis un chercheur publié qui comprend la science derrière vos résultats. Ma spécialité est la différenciation de l'expression génique (DGE) et l'identification des gènes clés à régulation positive ou négative pour votre étude.


### Ce que propose ce service (RNA-Seq DGE)


Je propose trois niveaux d'analyse basés sur mon pipeline éprouvé (FastQC, HISAT2, featureCounts, DESeq2). (Veuillez consulter ma FAQ ci-dessous concernant le nombre d'échantillons !).


* Basique (Les "Données") :

  Je réaliserai tout le pipeline jusqu'aux Read Counts (Étape 04). Ce forfait est idéal pour les chercheurs utilisant R/Python et ayant simplement besoin de la matrice de comptages finale.


* Standard (L'"Analyse") :

  Il s'agit de l'analyse complète de DGE (Étape 05). Vous obtenez tout ce qui est dans le forfait Basique, PLUS toutes les visualisations clés : graphique en volcan, PCA, et heatmap.


* Premium (L'"Insight PhD") :

  Le forfait complet prêt pour publication. Vous recevez tout dans le Standard, PLUS : un rapport PDF complet avec mon interprétation biologique experte (le "pourquoi") ET le Jupyter Notebook reproductible utilisé pour votre analyse.


**Veuillez me contacter avant de commander pour discuter de votre projet.

Langage de programmation:

Python

R

SPSS

Technologie:

Jupyter Notebook

Type d'analyse:

Analyse quantitative

Analyse qualitative

Expertise:

Analyse de cluster

Outils:

Pandas

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