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Je réaliserai une analyse différentielle RNA-seq et transcriptomique
Co-fondateur de The Freelance Bubble LLC
En tant que co-fondateur de The Freelance Bubble, je travaille avec une équipe pluridisciplinaire de plus de 23 chercheurs titulaires d’un doctorat, fournissant un soutien en recherche et en technolog...
Niveau 2
Répond à des critères de performance élevés et a fait ses preuves en matière de satisfaction clients.
Très réactif
Connu(e) pour ses réponses exceptionnellement rapides
À propos de ce service
Chez The Freelance Bubble, nous proposons des analyses professionnelles RNA-seq et transcriptomiques pour chercheurs, laboratoires, équipes académiques et projets biotech cherchant des résultats fiables, reproductibles et prêts à être publiés.
Notre équipe pluridisciplinaire possède une expertise en biodonnées, génomique, biologie moléculaire, statistiques et recherche scientifique pour accompagner les projets depuis la planification jusqu’à l’interprétation biologique.
Nos services incluent :
- Consultation RNA-seq et revue de projet
- Contrôle qualité et prétraitement
- Normalisation des comptages
- Analyse différentielle de l’expression génique
- Analyse en composantes principales et regroupement d’échantillons
- Heatmaps et diagrammes en volcan
- Annotation des gènes
- Analyse d’enrichissement GO et voies
- Interprétation fonctionnelle des gènes significatifs
- Figures et tableaux prêts à publication
- Scripts R/Python et workflows reproductibles
- Revue des résultats et support pour présentation
Nous utilisons R, Python, RStudio, DESeq2, edgeR, limma, Jupyter Notebook et autres outils de bioinformatique.
Contactez-nous avant de commander pour le traitement brut FASTQ, l’alignement, le RNA-seq single-cell, les grands cohortes ou les pipelines personnalisés.
Domaine:
Machine learning
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Autres
Langage de programmation:
Python
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R
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SQL
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Colab
•
Autres
Technologie:
Python
•
R
•
Jupyter Notebook
•
Pandas
•
RStudio
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Autres
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FAQ
Traduction automatique
Quels types de projets RNA-seq supportez-vous ?
Nous supportons les projets de bulk RNA-seq et transcriptomique impliquant l’expression différentielle, l’analyse de voies, l’enrichissement fonctionnel, le clustering, la visualisation et l’interprétation biologique.
Pouvez-vous analyser des fichiers FASTQ bruts ?
Oui, le traitement brut FASTQ peut être supporté comme un workflow personnalisé. Veuillez nous contacter avant de commander car l’alignement, la quantification et les grands ensembles de données peuvent nécessiter une extension du scope.
Quels outils utilisez-vous ?
Selon le projet, nous utilisons R, Python, RStudio, DESeq2, edgeR, limma, Jupyter Notebook et d’autres outils de bioinformatique appropriés.
Réalisez-vous une analyse différentielle de l’expression génique ?
Oui. Nous pouvons effectuer la normalisation, le test d’expression différentielle, l’analyse du fold-change, le filtrage par signification et la visualisation.
Pouvez-vous fournir des PCA, heatmaps et diagrammes en volcan ?
Oui. Nous proposons des visualisations professionnelles telles que des diagrammes PCA, des regroupements, des heatmaps, des diagrammes en volcan et autres figures pertinentes.
Réalisez-vous une analyse de voies et d’enrichissement ?
Oui. L’enrichissement fonctionnel, l’analyse Gene Ontology et l’analyse de voies peuvent être inclus selon le package choisi.
Vais-je recevoir le code source ?
Oui. Des scripts/notebooks R ou Python reproductibles peuvent être fournis selon la portée du projet.
Pouvez-vous aider à interpréter les résultats biologiques ?
Oui. Nous pouvons aider à interpréter les gènes significatifs, les voies enrichies, les motifs d’expression et leur pertinence pour votre question de recherche.
Fournissez-vous aussi des consultations en plus de l’analyse ?
Oui. The Freelance Bubble propose à la fois des consultations d’expert et une analyse pratique de transcriptomique, selon le package choisi.
Dois-je vous contacter avant de commander ?
Oui, notamment pour les fichiers bruts FASTQ, le RNA-seq single-cell, les grands cohortes, la transcriptomique de novo, les pipelines personnalisés ou les designs expérimentaux complexes.
