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Je vais effectuer des simulations de docking moléculaire et de dynamique
Dr. Zainab K.
Level 2
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À propos de ce service
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Contactez-nous avant de passer commande pour personnaliser votre projet !
Chez The Freelance Bubble, nous proposons des services d’expert en docking moléculaire et simulations MD pour soutenir vos projets de découverte de médicaments. Du criblage de ligands à l’analyse de la stabilité de liaison, nous fournissons des résultats reproductibles et prêts à être publiés.
- Docking débutant : Docking de 1 à 2 ligands avec la protéine cible + visualisation de l’affinité de liaison et de la pose. Analyse ADMET.
- Insight sur la liaison : 5 à 10 ligands, analyse des interactions, cartographie du site de liaison, et scores de docking comparatifs. Analyse ADMET.
- Suite de découverte dynamique : Docking complet + simulations MD (jusqu’à 100 ns) avec RMSD, RMSF, Rg, et graphiques de stabilité de liaison. (Discuter si vous avez besoin de plus de temps de simulation)
Outils et ressources :
- Docking protéine-ligand (AutoDock, PyRx),
- Simulations MD (GROMACS/AMBER),
- Analyse des interactions et de la stabilité (RMSD, RMSF, Rg, SASA),
- Calculs d’énergie et visualisations (PyMOL, Chimera).
- Analyse ADMET (SwissADME)
Inclut des rapports détaillés, des graphiques et des scripts reproductibles (sur demande).
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Découvrez Dr. Zainab K.
Dr. Zainab K.
Cofounder The Freelance Bubble
Level 2
- DePakistan
- Membre depuismai 2025
- Temps de réponse moy.1 heure
- Dernière commande1 mois
Langues
Anglais, Ourdou, Punjabi
As Co-Founder of The Freelance Bubble, I lead a team of 23+ PhD scholars dedicated to delivering high-quality academic and research support services, including Systematic Reviews, Meta-Analyses, Molecular Simulations, Bioinformatics, Data Analysis, and Scientific Writing.
Besides TFB, I am Biotechnologist turned Bioinformatician, I specialize in in-silico vaccine design, drug repurposing, and coding pipelines. We also organize workshops and training programs to advance research and computational expertise.
We also help start-ups in brandings and visuals.
Own a clothing brand, NayeeReet.
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FAQ
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Quels fichiers d’entrée avez-vous besoin de ma part ?
En général, j’ai besoin de la structure de votre protéine (format PDB) et du ou des ligands en formats MOL2/SDF/PDBQT. Si vous ne les avez pas, je peux vous aider à les préparer.
Quel logiciel utilisez-vous?
J’utilise AutoDock Vina, PyRx pour le docking, et GROMACS (ou AMBER sur demande) pour les simulations MD. Les visualisations sont créées avec PyMOL, Chimera ou VMD.
Pouvez-vous réaliser des simulations pour n’importe quelle protéine ?
Oui, tant qu’une structure 3D valide est disponible (PDB ou modèle par homologie), je peux effectuer le docking et les simulations MD.
Vais-je recevoir un rapport ?
Oui. Chaque package inclut un rapport PDF détaillé avec méthodes, résultats, graphiques (par exemple RMSD, RMSF) et visualisations de liaison. Les packages premium comprennent également les fichiers d’entrée/sortie et scripts.
Ces résultats sont-ils adaptés à la publication ou au travail de thèse ?
Absolument. Je suis des workflows de recherche et fournis des visuels et données prêts à publication.
Mes données sont-elles gardées confidentielles ?
Oui. Vos données sont entièrement confidentielles et ne seront pas partagées ni réutilisées sous aucune circonstance.
Avis
3 avis concernant ce service
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A amohseni298_
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États-Unis
Dr. Zainab has been a true professional, very knowledgeable, a pleasure to work with. She is honest and straight forward lady. the quality of her work is outstanding. She offers valuable professional advise to her clients. I am truly satisfy with her work and i would recommend her to my colleagues
50 $US-100 $US
Prix
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Utile?A audreylee04
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Australie
Very professional! I am happy with the service. :)
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11 jours
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Utile?I imenlaib
Algérie
Delivered on time with all the requested details. A good freelancer.
200 $US-400 $US
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4 semaines
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