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Je vais effectuer des simulations de docking moléculaire et de dynamique
Dr. Zainab K.
Level 2
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À propos de ce service
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Chez The Freelance Bubble, nous proposons des services professionnels de docking moléculaire et de simulation de dynamique moléculaire pour la découverte de médicaments, le criblage virtuel et l’étude des interactions protéine-ligand. Nous privilégions des workflows reproductibles, une interprétation claire et des résultats prêts à être publiés.
Nos forfaits incluent :
- Docking Starter : Docking de 1 à 2 ligands avec une protéine cible, comprenant l’affinité de liaison, la visualisation du meilleur pose, l’analyse des interactions et l’évaluation ADMET.
- Binding Insight : Docking de 5 à 10 ligands avec des scores comparatifs, la cartographie du site de liaison, le profilage des interactions, l’analyse des poses et l’évaluation ADMET.
- Dynamic Discovery Suite : Docking complet plus simulation MD jusqu’à 100 ns, incluant RMSD, RMSF, rayon de giration, SASA et analyse de la stabilité de liaison. Des simulations plus longues peuvent être organisées via une offre personnalisée.
Outils : AutoDock, PyRx, GROMACS, AMBER, PyMOL, Chimera et SwissADME.
Les livrables peuvent inclure des graphiques, des figures d’interaction, des tableaux de résultats, des rapports détaillés et des scripts reproductibles sur demande.
Veuillez nous contacter avant de commander pour personnaliser votre projet.
Découvrez Dr. Zainab K.
Dr. Zainab K.
Cofounder The Freelance Bubble LLC
Level 2
- DePakistan
- Membre depuismai 2025
- Temps de réponse moy.1 heure
- Dernière commande2 semaines
Langues
Anglais, Ourdou, Punjabi
As Co-Founder of The Freelance Bubble, I work with a multidisciplinary team of 23+ PhD scholars delivering high-quality research and technical support. I am a biotechnologist turned bioinformatician specializing in in-silico vaccine design, immunoinformatics, drug repurposing, molecular docking, genomics, NGS analysis, and computational pipelines. I also contribute to research workshops and training programs, support startup with branding and visuals, and am involved in entrepreneurship through the clothing brand NayeeReet.
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FAQ
Traduction automatique
Quels fichiers d’entrée avez-vous besoin de ma part ?
En général, j’ai besoin de la structure de votre protéine (format PDB) et du ou des ligands en formats MOL2/SDF/PDBQT. Si vous ne les avez pas, je peux vous aider à les préparer.
Quel logiciel utilisez-vous?
J’utilise AutoDock Vina, PyRx pour le docking, et GROMACS (ou AMBER sur demande) pour les simulations MD. Les visualisations sont créées avec PyMOL, Chimera ou VMD.
Pouvez-vous réaliser des simulations pour n’importe quelle protéine ?
Oui, tant qu’une structure 3D valide est disponible (PDB ou modèle par homologie), je peux effectuer le docking et les simulations MD.
Vais-je recevoir un rapport ?
Oui. Chaque package inclut un rapport PDF détaillé avec méthodes, résultats, graphiques (par exemple RMSD, RMSF) et visualisations de liaison. Les packages premium comprennent également les fichiers d’entrée/sortie et scripts.
Ces résultats sont-ils adaptés à la publication ou au travail de thèse ?
Absolument. Je suis des workflows de recherche et fournis des visuels et données prêts à publication.
Mes données sont-elles gardées confidentielles ?
Oui. Vos données sont entièrement confidentielles et ne seront pas partagées ni réutilisées sous aucune circonstance.
Avis
4 avis concernant ce service
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F faalsaeed
Arabie Saoudite
Collaboration en coursGreat communication, fast responses, and professional work. Very cooperative and reliable. Highly recommended.
50 $US-100 $US
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Utile?A audreylee04
Australie
Collaboration en coursVery professional! I am happy with the service. :)
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Z Réponse du freelance
Utile?A amohseni298_
États-Unis
Collaboration en coursDr. Zainab has been a true professional, very knowledgeable, a pleasure to work with. She is honest and straight forward lady. the quality of her work is outstanding. She offers valuable professional advise to her clients. I am truly satisfy with her work and i would recommend her to my colleagues
100 $US-200 $US
Prix
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Z Réponse du freelance
Utile?I imenlaib
Algérie
Delivered on time with all the requested details. A good freelancer.
200 $US-400 $US
Prix
4 semaines
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