J analyserai les trajectoires de dynamique moléculaire et les contacts ligand-protéine

J analyse les trajectoires existantes de dynamique moléculaire et je retourne des figures claires accompagnées des données numériques qui les sous-tendent.

La formule Basic couvre un système fourni jusqu à 100 ns : vérifications de correspondance des fichiers, RMSD des protéines et des ligands, RMSF des résidus, tableaux CSV modifiables, figure, scripts d analyse et un README décrivant les sélections, la référence et la fenêtre temporelle.

Veuillez fournir les fichiers de trajectoire correspondants, les fichiers de topologie et de structure, une description du système et votre question de recherche. La persistance des messages, les distances de poche et les comparaisons multi-systèmes sont traitées séparément.

Pour une simulation protéine-molécules petite molécule nouvelle, envoyez l identifiant protéine ou gène, l espèce et le nom du composé ou SMILES. La préparation de la structure, le choix des paramètres, un pilote de 10 ns et des exécutions sur le cloud plus longues peuvent être chiffrés séparément après vérification du système et des besoins de calcul.

Veuillez me contacter avant de commander pour confirmer la compatibilité des fichiers et l étendue. Une communication écrite est bienvenue. J utilise un codage assisté par IA et vérifie le code et les résultats ; dites-moi vos restrictions de traitement des données avant de partager les fichiers.